1340* – Vnútrozemské slaniská a slané lúky
1530* – Panónske slané stepi a slaniská
2340* – Vnútrozemské panónske pieskové duny
3140 – Oligotrofné až mezotrofné vody s bentickou vegetáciou chár
3160 – Prirodzené dystrofné stojaté vody
3220 – Horské vodné toky a bylinné porasty pozdĺž ich brehov
3230 – Horské vodné toky a ich drevinová vegetácia s myrikovkou nemeckou (Myricaria germanika)
3240 – Horské vodné toky a ich drevinová vegetácia s vŕbou sivou (Salix elaeagnos)
3260 – Nížinné až horské vodné toky s vegetáciou zväzu Ranunculion fluitantis a Callitricho-Batrachion
3270 – Rieky s bahnitými až piesočnatými brehmi s vegetáciou zväzov Chenopodion rubri p.p a Bidention p.p.
4030 – Suché vresoviská v nížinách a pahorkatinách
4060 – Vresoviská a spoločenstvá kríčkov v subalpínskom a alpínskom stupni
4070* – Kosodrevina
4080 – Spoločenstvá subalpínskych krovín
40A0* – Xerotermné kroviny
5130 – Porasty borievky obyčajnej
6110* – Pionierske porasty na plytkých karbonátových a bázických substrátoch zväzu Alysso-Sedion albi
6120* – Suchomilné travinno-bylinné porasty na vápnitých pieskoch
6150 – Alpínske travinno-bylinné porasty na silikátovom podklade
6170 – Alpínske a subalpínske vápnomilné travinno-bylinné porasty
6190 – Dealpínske travinno-bylinné porasty
6210 – Suchomilné travinno-bylinné a krovinové porasty na vápnitom substráte
6230* – Kvetnaté vysokohorské a horské psicové porasty na silikátovom substráte
6240* – Subpanónske travinno-bylinné porasty
6250* – Panónske travinno-bylinné porasty na spraši
6260* – Panónske travinno-bylinné porasty na pieskoch
6410 – Bezkolencové lúky
6430 – Vlhkomilné vysokobylinné lemové spoločenstvá na poriečnych nivách od nížin do alpínskeho stupňa
6440 – Aluviálne lúky zväzu Cnidion venosi
6510 – Nížinné a podhorské kosné lúky
6520 – Horské kosné lúky
7110* – Aktívne vrchoviská
7120 – Degradované vrchoviská schopné prirodzenej obnovy
7140 – Prechodné rašeliniská a trasoviská
7150 – Depresie na rašelinných substrátoch s Rhynchospora alba
7210* – Vápnité slatiny s maricou pílkatou a druhmi zväzu Caricion Davallianae
7220* – Penovcové prameniská
7230 – Slatiny s vysokým obsahom báz
8110 – Silikátové sutiny v montánnom až alpínskom stupni
8120 – Karbonátové sutiny v montánnom až alpínskom stupni
8150 – Nespevnené silikátové sutiny v kolínnom stupni
8160* – Nespevnené karbonátové skalné sutiny v montánnom až kolínnom stupni
8210 – Karbonátové skalné steny a svahy so štrbinovou vegetáciou
8220 – Silikátové skalné steny a svahy so štrbinovou vegetáciou
8230 – Pionierske spoločenstvá plytkých silikátových pôd
8310 – Nesprístupnené jaskynné útvary
9110 – Kyslomilné bukové lesy
9130 – Bukové a jedľovo-bukové kvetnaté lesy
9140 – Javorovo-bukové horské lesy
9150 – Vápnomilné bukové lesy
9170 – Dubovo-hrabové lesy lipové s absenciou smreka
9180* – Lipovo-javorové sutinové lesy
9190 – Vlhko a kyslomilné brezovo-dubové lesy
91D0* – Brezové, borovicové a smrekové lesy na rašeliniskách
91E0* – Lužné vŕbovo-topoľové a jelšové lesy
91F0 – Lužné dubovo-brestovo-jaseňové lesy okolo nížinných riek
91G0* – Karpatské a panónske dubovo-hrabové lesy
91H0* – Teplomilné panónske dubové lesy
91I0* – Eurosibírske dubové lesy na spraši a piesku
91M0 – Panónsko-balkánske cerové lesy
91N0* – Panónske topoľové lesy s borievkou
91Q0 – Reliktné vápnomilné borovicové a smrekovcové lesy
9410 – Horské smrekové lesy
9420 – Smrekovcovo-limbové lesy
Prioritné biotopy sú označené *
Hlavný zdroj informácií: www.sopsr.sk