V geomorfologickom celku Horehronské podolie sa nachádza celkom 97 jaskýň (údaj k 31.12.2017). Z toho v podcelku Lopejská kotlina je to 35 jaskýň, v podcelku Bystrianske podhorie je to 52 jaskýň a v podcelku Heľpianske podolie je to 10 jaskýň.
Podcelok Lopejská kotlina
Diakovo
Dolnolehotská jaskyňa (Lehôtska jaskyňa)
Dúpna skala 1
Dúpna skala 2
Dvor
Hradisko
Jaskyňa I
Jaskyňa II
Jaskyňa pod horárňou
Jaskyňa pod Kalváriou (Jaskyňa na Hrádku, Predajná 1)
Jaskyňa pri acetylénke
Jaskyňa pri nádrži
Jaskyňa pri potoku I
Jaskyňa pri potoku II
Jaskyňa v skalke (Jaskyňa nad elektrárňou)
Líščia jaskyňa (kataster obce Dolná Lehota)
Líščia jaskyňa (kataster obce Valaská)
Mokrá jaskyňa
Pieskový potok
Ponorová jaskyňa
Predajná 2 (Jaskyňa pod Kalváriou č.2)
Predajná 3 (Jaskyňa pod Kalváriou č.3)
Predajná 4
Puklinová horná jaskyňa
Riečna jaskyňa
Smradľavá jaskyňa
Svinárka
Travertínová jaskyňa vo Vajskovej
Večernica
Vlčia jama (Zámostská tunelová jaskyňa)
Zámostie 1
Zámostie 2
Zámostie 3
Zámostie 4
Zámostie 5
Podcelok Bystrianske podhorie
Bystrianska jaskyňa-Nová Jaskyňa
Bystriansky závrt
Diera v Potôčkach I
Diera v Potôčkach II
Hlboká jaskyňa
Horná jaskyňa
Chalupkova jaskyňa (Jaskyňa pri ceste)
Jaskyňa na ceste
Jaskyňa nad cestou
Jaskyňa nad Hlbokou
Jaskyňa pod hradiskom
Jaskyňa pod Starou jaskyňou (Jaskyňa pod Starou Bystrianskou jaskyňou s oknom)
Jaskyňa pod Svibovou
Jaskyňa v brale I
Jaskyňa v kameňolome Potôčky 1 a 2
Jaskyňa v kameňolome Potôčky 3
Jaskyňa v ponore (Udiera dolná, Udiery II)
Jaskyňa v Príslope
Jaskyňa v závrte
Jaskyňa vo Vŕškoch
Javorová vyvieračka
Kľučková dierka
Konská jaskyňa
Kostnica
Líščia diera (Líščia jaskyňa)
Mločí závrt
Mýtska jaskyňa (Štiavnička)
Okno (Jaskyňa v brale II)
Pavúčia jaskyňa (kataster obce Horná Lehota)
Pavúčia jaskyňa (kataster obce Valaská)
Pivnica 2
Pivnica 3
Pivnica 4
Pod Varguľou 1
Pod Varguľou 2
Poľovnícka trhlina
Prepadlisko na Valaskej
Pri diere (U diery, Udiera)
Puklinová jaskyňa
Puklinová jaskyňa (Jaskyňa v brale III)
Riavka
Sonda nad Potôčkami
Sonda Veverica
Starý výver
Studená diera
Teplá diera
Trhlina v Prostrednom vrchu
Valachova pivnica
Varguľa
Vierka
Zimné slnko (Sonda pod Svibovou, Koreňová jaskyňa)
Železná jaskyňa
Podcelok Heľpianske podolie
Dudlavá skala
Dudlavá skala malá
Dudlavá skala menšia
Jaskyňa pod smrekom
Jaskyňa v doline (Jaskyňa pri murovanom mlyne, Grúň)
Jaskyňa vo vodojeme
Márnikova jaskyňa
Ploská jaskyňa pod Grúňom
Švajkova jaskyňa I (Gigadzova jaskyňa, Jaskyňa č.67, Jaskyňa pri stožiari)
Švajkova jaskyňa II (Jaskyňa č.68)