Na území okresu Banská Štiavnica sa nachádza 1 národná prírodná rezervácia, 5 prírodných rezervácií, 1 prírodná pamiatka a 3 chránené areály. Arborétum Kysihýbeľ Banskoštiavnická botanická záhrada Gajdošovo Holík Jabloňovský Roháč Kamenný jarok Michalské rašelinisko Pralesy Slovenska – Balov grúň Sitno Žakýlske pleso
Na území okresu Banská Bystrica sa nachádza 7 národných prírodných rezervácií, 20 prírodných rezervácií, 2 národné prírodné pamiatky, 15 prírodných pamiatok a 8 chránených areálov. Badínsky prales Barania hlava Baranovo Bátovský balvan Brvnište Čačínska cerina Dekretov porast Dekrétova jaskyňa Harmanecká jaskyňa Harmanecká tisina Harmanecký Hlboký jarok Horná Roveň Hrochotská Bukovina Jakub Jánošíkova skala Jelenecká jaskyňa Jelšovec Kopec Kozlinec Králická tiesňava Krásno Kremenie Ľubietovský Vepor Ľupčiansky skalný hríb Mackov bok Mačková Majerova skala Malachovské skalky Mičinské travertíny Moštenické travertíny Netopieria jaskyňa Pavelcovo Periská Plavno Podlavické výmole Ponická dúbrava Ponická jaskyňa Potok Zolná Pralesy Slovenska – Bukovina Pralesy Slovenska – Bútľavka Pralesy...
Za chránený strom bola vyhlásená v roku 1996. Duglaska tisolistá s výškou 30m, obvodom kmeňa 274cm, priemerom koruny 15m a vekom 100 rokov. Svojim zdravotným stavom a mohutnosťou kmeňa je ojedinelým exemplárom v tunajších lesných porastoch. Je chránená z vedeckých a ekologických dôvodov. Nachádza sa pri obci Stará Kremnička v lokalite Ždáňska Studňa pri ústí prameňa Potôčik.
Za chránené stromy boli vyhlásené v roku 1986 a 1996. Skupina štyroch stromov. Dva exempláre javora mliečneho s výškou 21 a 23m, obvodom kmeňa 220 a 240cm, priemerom koruny 7 a 9m a vekom 80 rokov a dva exempláre smrekovca opadavého s výškou 26 a 27m, obvodom kmeňa 240 a 245cm, priemerom koruny 8 a 9m a vekom 80 rokov. Boli vysadené pri pamätníku profesora Dr. Henricha Davida Wilckensa /1763-1832/, zakladateľa lesníckej vedy, významnej osobnosti v histórii lesníctva na Slovensku. Sú chránené z náučných, kultúrnych a výchovných dôvodov. Nachádzajú sa v obci Repište na križovatke pri odbočke na Detvu.
Za chránený strom bol vyhlásený v roku 1996. Starý, mohutný, esteticky významný dub letný s výškou 23m, obvodom kmeňa 355cm, priemerom koruny 20m a odhadovaným vekom 200 rokov. Je chránený z vedeckých, ekologických a krajinárskych dôvodov. Nachádza sa pred obcou Lutila pri ceste do obce Lovčica-Trubín asi 100m od odbočky štátnej cesty Žiar nad Hronom – Handlová.
Za chránený strom bola vyhlásená v roku 1996. Lipa veľkolistá s výškou 25m, obvodom kmeňa 500 cm, priemerom koruny 14m a vekom 250 rokov. Je chránená z vedecko-výskumných, náučných, kultúrno-výchovných, ekologických, krajinárskych a estetických dôvodov. Nachádza sa v obci Kremnické Bane asi 1000m od rázcestia štátnej cesty z Kremnice do Martina a miestnej komunikácie na Staré Piargy.
