Územie mestskej časti bolo 19.9.1990 vyhlásené za pamiatkovú zónu vidieckeho typu.
Územie mestskej časti Vajnory bolo 16.11.1990 vyhlásené za pamiatkovú zónu vidieckeho typu. V roku 2008 boli upravené jej hranice.
Areál rušňového depa Bratislava-východ bol 10.3.2008 vyhlásený za pamiatkovú zónu špeciálneho typu.
Územie širšieho centra mesta, tzv. centrálna mestská oblasť bolo 18.8.1992 vyhlásené za pamiatkovú zónu mestského typu. V roku 2005 boli aktualizované jej hranice.
Územie historického Starého Mesta bolo 5.10.1954 vyhlásené za mestskú pamiatkovú rezerváciu. Nariadením 596/2001 z 13.12.2001 s účinnosťou od 1.1.2002 boli vymedzené jej hranice. Cieľom vymedzenia hraníc pamiatkovej rezervácie je zabezpečiť ochranu a využívanie historických, urbanistických, architektonických, výtvarných, krajinárskych a kultúrno-spoločenských hodnôt pamiatkovej rezervácie v súvislosti s ich ohrozením vyvolaným zmenami životného štýlu a transformáciou spoločenských a ekonomických podmienok. Predmetom ochrany je kultúrno-historické a prírodné prostredie pamiatkovej rezervácie s jej historickou a urbanisticko-architektonickou skladbou zástavby. Celková výmera pamiatkovej rezervácie je 46,5ha. Tvorí ju hrad s podhradím a historické jadro mesta. Vzhľad historického jadra mesta určujú zachované meštianske domy a mestské paláce, v jadre stredoveké, viac ráz v 15. a 16.storočí prestavané...
Historické jadro mesta bolo 11.9.1987 vyhlásené za mestskú pamiatkovú rezerváciu. Celková výmera rezervácie je 85,15ha. V roku 2015 sa v pamiatkovej rezervácii nachádzalo 112 kultúrnych pamiatok.