Územie okresu Sobrance zasahuje 1 chránená krajinná oblasť a 2 chránené vtáčie územia. CHKO Vihorlat CHVÚ Senianske rybníky CHVÚ Vihorlatské vrchy
Územie okresu Michalovce zasahujú 2 chránené krajinné oblasti a 4 chránené vtáčie územia. CHKO Latorica CHKO Vihorlat CHVÚ Medzibodrožie CHVÚ Ondavská rovina CHVÚ Senianske rybníky CHVÚ Vihorlatské vrchy
Územie okresu Rožňava zasahujú 2 národné parky a 4 chránené vtáčie územia. NP Slovenský kras NP Slovenský raj CHVÚ Muránska planina-Stolica CHVÚ Slovenský kras CHVÚ Slovenský raj CHVÚ Volovské vrchy
Územie okresu Košice-okolie zasahuje 1 národný park a 4 chránené vtáčie územia. NP Slovenský kras CHVÚ Košická kotlina CHVÚ Slanské vrchy CHVÚ Slovenský kras CHVÚ Volovské vrchy
Územie okresu Košice II zasahuje 1 chránené vtáčie územie. CHVÚ Košická kotlina
Územie okresu Košice I zasahuje 1 chránené vtáčie územie. CHVÚ Volovské vrchy