Na území okresu Kežmarok sa nachádzajú 2 národné prírodné rezervácie, 7 prírodných rezervácií a 3 prírodné pamiatky. Belianske lúky Beliansky potok Jaskyňa v Skalke Jazero Jezerské jazero Kút Malé jazerá Mokriny Pálenica Poš Slavkovský jarok Veľké osturnianske jazero
Na území okresu Humenné sa nachádzajú 3 národné prírodné rezervácie, 4 prírodné rezervácie a 2 prírodné pamiatky. Brekovská jaskyňa Čierny potok Humenská Humenský Sokol Chlmecká skalka Iľovnica Jasenovská bučina Kyjovský prales Vihorlatský prales
Na území okresu Bardejov sa nachádza 5 národných prírodných rezervácií a 5 prírodných rezervácií. Becherovská tisina Čergovský Minčol Livovská jelšina Pod Beskydom Pralesy Slovenska – Busov Pramenisko Tople Regetovské rašelinisko Slatina pod Lieskovcom Stebnícka Magura Zborovský hradný vrch
Za chránený strom bola vyhlásená v roku 1990 a 1997. Borovica Jeffreyova s výškou 25m, obvodom kmeňa 249cm, priemerom koruny 8m a vekom viac ako 200 rokov. Je chránená z vedecko-výskumných, náučných, ekologických, kultúrno-historických a estetických dôvodov. Nachádza sa v blízkosti obce Zámutov v lesnom poraste.
Za chránený strom bol vyhlásený v roku 1990 a 1997. Platan západný s výškou 18m, obvodom kmeňa 430cm, priemerom koruny 32m a vekom viac ako 200 rokov. Je chránený z ekologických, vedecko-výskumných, náučných, estetických a kultúrno-historických dôvodov. Nachádza sa v obci Tovarné v areáli základnej školy.
Za chránený strom bol vyhlásený v roku 1990 a 1997. Dub letný s výškou 25m, obvodom kmeňa 590cm, priemerom koruny 27m a vekom viac ako 200 rokov. Je chránený z ekologických, vedecko-výskumných, náučných, estetických a kultúrno-historických dôvodov. Nachádza sa v extraviláne západne asi 3km od obce Rudlov.