Na území okresu Humenné sa nachádza 17 území európskeho významu. Alúvium Rieky (SKUEV0049) Belušky (SKUEV0897) Beskyd (SKUEV0387) Brekovský hradný vrch (SKUEV0231) Brekovský hradný vrch (SKUEV2231) Drieňová (SKUEV0005) Hubková (SKUEV0205) Humenská (SKUEV0206) Humenský Sokol (SKUEV0050) Krivoštianka (SKUEV0250) Kyjovský prales (SKUEV0051) Makovica (SKUEV0230) Morské oko (SKUEV0209) Pod Čierťažou (SKUEV0896) Stredný tok Laborca (SKUEV0895) Sútok Udavy s Ílovnicou (SKUEV0233) Vihorlat (SKUEV0025)
Na území okresu Bardejov sa nachádza 8 území európskeho významu. Becherovská tisina (SKUEV0937) Čergov (SKUEV0332) Čergovský Minčol (SKUEV0331) Horný tok Tople (SKUEV0936) Livovská jelšina (SKUEV0943) Regetovské rašelinisko (SKUEV0755) Stebnícka Magura (SKUEV0754) Tvarožecké lúky (SKUEV0952)
Na území okresu Vranov nad Topľou sa nachádzajú 2 národné prírodné rezervácie, 5 prírodných rezervácií, 5 prírodných pamiatok a 3 chránené areály. Hermanovské skaly Hlinianska jelšina Medzianske skalky Oblík Petkovský potok Pralesy Slovenska – Čierna hora Radvanovské skalky Skaly pod Pariakovou Šimonka Štefanovská borina Zámutovská jelšina Zámutovské skaly Zapikan Zárez Stravného potoka Žipovské mŕtve rameno
Na území okresu Svidník sa nachádza 1 národná prírodná rezervácia, 3 prírodné rezervácie a 1 chránený areál. Dranec Komárnická jedlina Miroľská slatina Radomka Radomská slatina
Na území okresu Stropkov sa nachádzajú 2 chránené areály. Driečna Horný tok Chotčianky
Na území okresu Stará Ľubovňa sa nachádza 1 národná prírodná rezervácia, 1 prírodná rezervácia, 1 národná prírodná pamiatka, 8 prírodných pamiatok, 1 chránený areál a 1 obecné chránené územie. Aksamitka Čergovský Minčol Jaskyňa v Čube Kyjovské bradielko Litmanovský potok Lysá hora Okrúhly kopec Plavečské štrkoviská Rebrá Rička Skalná ihla Slatina pri Šarišskom Jastrabí Údolské skalky
