Na území okresu Kežmarok sa nachádza 12 území európskeho významu. Belianske lúky (SKUEV0144) Beliansky potok (SKUEV0333) Jordanec (SKUEV0950) Malé osturnianske jazerá (SKUEV0335) Osturniansky potok (SKUEV0712) Pieniny (SKUEV0337) Pieniny (SKUEV1337) Poš (SKUEV0709) Stredný tok Popradu (SKUEV0951) Tatry (SKUEV0307) Trstinné lúky (SKUEV0945) Veľké osturnianske jazero (SKUEV0334)
Na území okresu Humenné sa nachádza 17 území európskeho významu. Alúvium Rieky (SKUEV0049) Belušky (SKUEV0897) Beskyd (SKUEV0387) Brekovský hradný vrch (SKUEV0231) Brekovský hradný vrch (SKUEV2231) Drieňová (SKUEV0005) Hubková (SKUEV0205) Humenská (SKUEV0206) Humenský Sokol (SKUEV0050) Krivoštianka (SKUEV0250) Kyjovský prales (SKUEV0051) Makovica (SKUEV0230) Morské oko (SKUEV0209) Pod Čierťažou (SKUEV0896) Stredný tok Laborca (SKUEV0895) Sútok Udavy s Ílovnicou (SKUEV0233) Vihorlat (SKUEV0025)
Na území okresu Bardejov sa nachádza 8 území európskeho významu. Becherovská tisina (SKUEV0937) Čergov (SKUEV0332) Čergovský Minčol (SKUEV0331) Horný tok Tople (SKUEV0936) Livovská jelšina (SKUEV0943) Regetovské rašelinisko (SKUEV0755) Stebnícka Magura (SKUEV0754) Tvarožecké lúky (SKUEV0952)
Na území okresu Zlaté Moravce sa nachádza 7 území európskeho významu. Člnok (SKUEV0874) Gýmeš (SKUEV0131) Hôrky (SKUEV2133) Kostolianske lúky (SKUEV0132) Mochovská cerina (SKUEV0867) Pohronský Inovec (SKUEV0873) Včelár (SKUEV0868)
Na území okresu Topoľčany sa nachádza 10 území európskeho významu. Bočina (SKUEV0135) Dolné lazy (SKUEV0136) Hôrky (SKUEV0133) Hôrky (SKUEV2133) Hradná dolina (SKUEV0024) Kulháň (SKUEV0134) Prašická dubina (SKUEV0880) Prieľačina (SKUEV0565) Vinište (SKUEV0021) Záhrada (SKUEV0137)
Na území okresu Šaľa sa nachádzajú 2 územia európskeho významu. Juhásove slance (SKUEV0080) Síky (SKUEV0088)
