Na území okresu Gelnica sa nachádzajú 2 prírodné rezervácie a 2 prírodné pamiatky. Kloptaň Margecianska línia Polianske rašelinisko Závadské skalky
Za chránené stromy boli vyhlásené v roku 1996. Dva exempláre dubu letného s výškou 25 a 22m, obvodom kmeňa 625 a 503cm, priemerom koruny 19 a 23m a vekom viac ako 250 a 200 rokov. Sú chránené z vedeckých, náučných, biologických, estetických a krajinárskych dôvodov. Nachádzajú sa v obecnom parku v časti Veľký Kazimír.
Za chránený strom bol vyhlásený v roku 1996. Platan západný s výškou 25m, obvodom kmeňa 410cm, priemerom koruny 29m a vekom viac ako 150 rokov. Je chránený z náučných, vedeckých, krajinárskych a estetických dôvodov. Nachádza sa v obci Veľaty pri miestnej základnej škole.
Za chránené stromy boli vyhlásené v roku 1996. Dva exempláre dubu letného s výškou 25 a 20m, obvodom kmeňa 600 a 657cm, priemerom koruny 30 a 29m a vekom viac ako 250 a 300 rokov. Sú chránené z vedeckých, náučných, estetických a krajinárskych dôvodov. Nachádzajú sa v obci Parchovany.
Za chránený strom bol vyhlásený v roku 1996. Pagaštan konský s výškou 21m, obvodom kmeňa 388cm, priemerom koruny 15m a vekom viac ako 180 rokov. Je chránený z estetických, náučných, vedeckých a krajinárskych dôvodov. Patrí k významným krajinným prvkom. Nachádza sa v obci Parchovany v časti Božčice.
Za chránené stromy boli vyhlásené v roku 1996. Tri exempláre platanu západného s výškou 28m, obvodom kmeňa 415, 410 a 470cm, priemerom koruny 32, 20 a 33m a vekom viac ako 200 rokov. Sú chránené z vedeckých, estetických, náučných a krajinárskych dôvodov. Nachádzajú sa v obci Biel v historickom parku.