Na území okresu Kysucké Nové Mesto sa nachádza 1 územie európskeho významu. Ľadonhora (SKUEV0834)
Na území okresu Dolný Kubín sa nachádza 10 území európskeho významu. Choč (SKUEV0305) Kysucké Beskydy (SKUEV0288) Malá Fatra (SKUEV0252) Orava (SKUEV0243) Pramene Hruštínky (SKUEV0185) Prosečné (SKUEV0192) Šíp (SKUEV0663) Váh (SKUEV0253) Veľká Fatra (SKUEV0238) Zázrivské lazy (SKUEV0251)
Na území okresu Čadca sa nachádza 19 území európskeho významu. Alúvium Markovho potoka (SKUEV0832) Bystrické sihly (SKUEV0647) Chmúra (SKUEV0289) Javornícky hrebeň (SKUEV0642) Klokočovské rašeliniská (SKUEV0101) Klokočovské rašeliniská (SKUEV2101) Kysucké Beskydy (SKUEV0288) Kysucké Beskydy (SKUEV2288) Malý Polom (SKUEV0657) Olešnianske rašeliniská (SKUEV0671) Polesie (SKUEV0830) Predmieranka (SKUEV0655) Príslop (SKUEV0648) Rakovsko-milošovské rašeliniská (SKUEV0838) Starobystrické penovcové pramenisko (SKUEV0777) Stredný tok Bystrice (SKUEV0835) Sútok Kysuce s Bystricou (SKUEV0833) Zákopčianske lúky (SKUEV0836) Zemanovská sihla (SKUEV0831)
Na území okresu Bytča sa nachádza 5 území európskeho významu. Javornícky hrebeň (SKUEV0642) Kolárovické lúky (SKUEV0839) Petrovička (SKUEV0644) Ráztocké penovcové pramenisko (SKUEV0643) Strážovské vrchy (SKUEV0256)
Na území okresu Trnava sa nachádza 7 území európskeho významu. Biele hory (SKUEV0267) Biele hory (SKUEV1267) Bolerázske sysľovisko (SKUEV0948) Brezovské Karpaty (SKUEV0278) Brezovské Karpaty (SKUEV1278) Buková (SKUEV0268) Nad vinicami (SKUEV0277)
Na území okresu Skalica sa nachádza 6 území európskeho významu. Gbelský les (SKUEV0904) Havran (SKUEV0901) Holíčske alúvium Moravy (SKUEV0905) Skalické alúvium Moravy (SKUEV0315) Skalické alúvium Moravy (SKUEV2315) Veterník (SKUEV0902)